「人と自然の共生」がテーマの博物館。収蔵資料は100万点以上にのぼり、その一部を「兵庫の自然誌」「人と自然」などの5つの主題で常設展示しています。展示のほかに、化石などの標本を自由に手にとって触ることが出来るコーナーや兵庫県の自然環境情報、電子図鑑などを見ることが出来る情報端末コーナーもあります。また、研究員などによる豊富なセミナーやイベントを開催しています。